Sistem penjaminan mutu yang banyak diterapkan oleh Perguruan Tinggi (PT) di Indonesia menggunakan beberapa model sistem mutu yaitu: sistem penjaminan mutu yang dikeluarkan oleh Kemdiknas, ISO 9001:2008, dan Malcolm Balridge National Quality Award (MBNQA). Beberapa PT bahkan menggabungkan sistem-sistem mutu tersebut seperti Universitas Airlangga Surabaya dan Universitas Bina Nusantara Jakarta merupakan contoh PT yang menerapkan ISO 9001:2008 dengan IWA-2, dan MBNQA, di samping sistem penjaminan mutu Kemdiknas yang diakreditasi melalui Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT). Sementara itu beberapa PT lain menggunakan ISO 9001:2008 sebagai basis dari sistem penjaminan mutunya, di samping sistem penjaminan mutu Kemdiknas.
